Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms