Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr4Q9Z1L2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms