Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zkscan5Q9Z1D8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan5Q9Z1D8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zkscan5Q9Z1D8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms