Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup160Q9Z0W3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup160Q9Z0W3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms