Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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