Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnip1Q9WUU8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms