Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trpv2Q9WTR1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms