Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TapbpQ9R233 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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