Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psmb3Q9R1P1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms