Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed2Q9R0Q3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed2Q9R0Q3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms