Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trpc3Q9QZC1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trpc3Q9QZC1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trpc3Q9QZC1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trpc3Q9QZC1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trpc3Q9QZC1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc3Q9QZC1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Trpc3Q9QZC1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trpc3Q9QZC1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trpc3Q9QZC1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc3Q9QZC1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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