Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn8Q9QZ49 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms