Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf11Q9QYK7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf11Q9QYK7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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