Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx4Q9QY61 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx4Q9QY61 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms