Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc5Q9QX29 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms