Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolkQ9QUG2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms