Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms