Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc2lQ9JME7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms