Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prg4Q9JM99 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Prg4Q9JM99 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Prg4Q9JM99 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prg4Q9JM99 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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