Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cabp1Q9JLK7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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