Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms