Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Tgm1Q9JLF6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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