Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prg3Q9JL95 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prg3Q9JL95 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg3Q9JL95 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms