Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod2Q9JKK7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod2Q9JKK7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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