Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Uchl3Q9JKB1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Uchl3Q9JKB1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Uchl3Q9JKB1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uchl3Q9JKB1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Uchl3Q9JKB1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Uchl3Q9JKB1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Uchl3Q9JKB1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Uchl3Q9JKB1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Uchl3Q9JKB1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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