Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpf2Q9JJ80 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms