Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms