Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmbr1Q9JIT0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms