Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gtf2ird1Q9JI57 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf2ird1Q9JI57 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gtf2ird1Q9JI57 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms