Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms