Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms