Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim39Q9ESN2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim39Q9ESN2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim39Q9ESN2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim39Q9ESN2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim39Q9ESN2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Trim39Q9ESN2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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