Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ush1cQ9ES64 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms