Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParvbQ9ES46 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms