Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Clstn2Q9ER65 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn2Q9ER65 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms