Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn12Q9ER56 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms