Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igdcc4Q9EQS9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms