Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms