Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tlr1Q9EPQ1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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