Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clstn1Q9EPL2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn1Q9EPL2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms