Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bap18Q9DCT6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Bap18Q9DCT6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms