Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xab2Q9DCD2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xab2Q9DCD2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms