Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne8Q9DC53 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms