Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Csnk1dQ9DC28 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Csnk1dQ9DC28 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Csnk1dQ9DC28 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Csnk1dQ9DC28 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Csnk1dQ9DC28 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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