Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms