Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smg9Q9DB90 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms