Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pop5Q9DB28 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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