Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAA3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAA3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAA3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9DAA3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q9DAA3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms