Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph3bQ9DA80 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms