Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd8Q9DA37 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd8Q9DA37 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms